祖源基因检测

原创 刘, 楚齐  2018-06-07 15:42  阅读 20 次
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我们总是想知道自己从哪里来?祖先是谁?血统如何?通过一本厚厚的族谱,你可能只能发现自己有文字记载的祖先,但是你的起点到底在哪里呢?祖源基因检测的出现正好解决了这个问题。

那么究竟什么是祖源基因检测,这种检测靠谱吗?

用于商业的祖源分析有两种,一种是基于常染色体的祖源成分分析,一种是Y染色体或者线粒体DNA的单倍型。

关于这种基于大数据的相关性研究问题,可以简化为三个纬度的问题:1. 使用的数据量大小 2. 可追溯时间的长短/因果关系明确与否 3. 预测的准确与否。而每个相关性研究只能最多满足数据量大,追溯时间长/因果关系明确和预测准确中的两个正向指标。

将这个简化的理论应用于祖源问题,显然,单倍型分析类似于简单性状,所需数据量小,可以做到追溯时间长,以及预测准确。而对于常染色体祖源成分分型,就是复杂性状了,做到了使用的数据量大,预测准确程度不及单倍型分析,但可以随着数据量增加而改善,比如PCA分析中汉人和日本人可以非常好地被区分成明显的两个群体,但汉人和韩国人就稍难——但通过增大数据量,有希望获得更加准确的结果。但是追溯时间/因果确定性就是一个短板,比如我们可以知道我们染色体哪些区域更像现今的韩国人,哪些更像现今的大部分汉人。然而我们不能说,那些更像韩国人的部分(相关性),就是来自韩国人的祖先(因果)(所以测出百分之几十韩国人成分的同学也不要焦虑)。除非我们可以收集到很多很多从古到今各个时间点的大量汉人和朝鲜人的DNA样品,详细地研究染色体的特征、分化时间,才能确定像韩国人的染色体区域有多大几率来自朝鲜人祖先或汉人祖先。然而这个受常染色体高频率的重组和突变影响,时间维度的扩展是很难的。总体说,单倍型的分析,可以说是很靠谱的了,常染色体祖源成分的分析,从原理上就会差很多。但是随着人类可用基因组数据的数据量的爆发,两者的靠谱程度肯定都会增长,而本来较为不靠谱的常染色体祖源分析的准确程度,则会增长得更快。

理解了祖源基因分析的原理之后,我们可以比较清晰的认识这种检测是否值得信赖了。首先,我们应该明确一点,很少有人的血统十分纯正。人类的足迹遍布世界,经常性的因为各种原因到处迁徙。各个人种、种族之间更是会出现互相通婚的情况,想要明确自己真正的祖先到底是什么,还不如说其实是一地球上最早的单细胞生物。其次,由于时间久远,我们很难收集到大量的不同种族的人类基因,很多时候,我们只能根据现有的比较纯正的血统进行分析,当然这种纯正也无法保证百分百。举一个简单的例子,南宋的时候北方人民大量南迁,然后是世代在南方生活,血统已经完全的南方化了,过了千年,变成了土生土长的南方人也不奇怪。再次,祖源基因检测的技术尚在不断完善,技术的进步可能会推翻之前的检测结论也不一定,因此,切不要迷信这种检测。

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