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血液中与免疫反应有关的乳腺肿瘤的分子指纹

编辑方/2018-03-30/ 分类:最新/阅读:
研究人员利用新开发的软件显示,乳腺癌肿瘤细胞中的基因和分子过程与血细胞(包括免疫系统细胞)中的基因和过程密切相关。 ...

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研究人员利用新开发的软件显示,乳腺癌肿瘤细胞中的基因和分子过程与血细胞(包括免疫系统细胞)中的基因和过程密切相关。这些发现发表在PLOS Computational Biology上。

即使肿瘤没有转移,它的作用也远远超出了发现它的身体部位。例如,肿瘤影响参与机体对癌症反应的免疫系统细胞中的基因表达。这些细胞在血液循环中遍布全身。

在这项新研究中,由Vanessa Dumeaux领导的一个团队在她的时间在麦吉尔大学(McGill University)检查了乳腺癌肿瘤和血流中基因表达之间的联系。他们构建了一种名为MIxT(匹配组织间相互作用)的新软件工具,它使用计算和统计方法来查找和调查不同身体组织中基因表达之间的联系。

该团队使用MIxT根据173位乳腺癌患者的血液和肿瘤样本中发现的RNA序列分析基因表达。该软件允许他们将基因聚类成与特定分子过程相关的组,并查看肿瘤和血细胞中哪些过程彼此相关。

分析表明,乳腺癌肿瘤分子过程与血流之间的联系确实存在,但它们根据肿瘤亚型而有所不同。例如,研究人员发现免疫系统抑制过程与某些乳腺癌亚型(包括基底乳腺癌亚型)联合使用。

“这项努力使社区超越了大多数以前关注肿瘤微环境中免疫细胞的分子研究的障碍,为我们的身体和免疫系统如何应对特定肿瘤存在的挑战提供了更广阔的视野,”Dumeaux说。

这些发现可能导致未来研究潜在的新方法,通过观察肿瘤外部并利用患者全身免疫系统反应来治疗和监测乳腺癌。

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